Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TLR1Q15399 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TLR1Q15399 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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