Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TTF1Q15361 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TTF1Q15361 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
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