Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC3Q15034 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC3Q15034 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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