Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
R3HDM1Q15032 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
R3HDM1Q15032 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
R3HDM1Q15032 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
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