Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERPUD1Q15011 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERPUD1Q15011 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms