Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHD4Q14839 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHD4Q14839 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
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