Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM53BQ14153 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM53BQ14153 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53BQ14153 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53BQ14153 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53BQ14153 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53BQ14153 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53BQ14153 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM53BQ14153 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53BQ14153 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53BQ14153 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53BQ14153 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53BQ14153 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53BQ14153 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM53BQ14153 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM53BQ14153 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53BQ14153 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53BQ14153 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53BQ14153 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53BQ14153 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53BQ14153 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53BQ14153 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM53BQ14153 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53BQ14153 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53BQ14153 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM53BQ14153 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM53BQ14153 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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