Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL4A6Q14031 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A6Q14031 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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