Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE6HQ13956 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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