Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAPGEF1Q13905 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAPGEF1Q13905 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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