Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA7Q13683 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA7Q13683 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA7Q13683 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA7Q13683 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA7Q13683 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA7Q13683 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA7Q13683 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA7Q13683 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA7Q13683 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA7Q13683 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA7Q13683 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA7Q13683 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms