Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TPBGQ13641 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPBGQ13641 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TPBGQ13641 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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TPBGQ13641 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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TPBGQ13641 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPBGQ13641 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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