Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF4BQ13523 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF4BQ13523 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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