Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SF3B2Q13435 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SF3B2Q13435 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
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