Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNTA1Q13424 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNTA1Q13424 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNTA1Q13424 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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