Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
PDE3BQ13370 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PDE3BQ13370 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PDE3BQ13370 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PDE3BQ13370 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
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