Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.361e-9■■■■■ 33.2
PABPC4Q13310 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.51e-9■■■■■ 33.2
PABPC4Q13310 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.953e-8■■■■■ 33.2
PABPC4Q13310 CTSC-201ENST00000227266 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-14■■■■■ 33.2
PABPC4Q13310 CDKN1C-205ENST00000471157 944 ntTSL 229.57■■■□□ 2.322e-6■■■■■ 33.2
PABPC4Q13310 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.731e-8■■■■■ 33.1
PABPC4Q13310 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.451e-8■■■■■ 33.1
PABPC4Q13310 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 33.1
PABPC4Q13310 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.814e-7■■■■■ 33.1
PABPC4Q13310 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.044e-7■■■■■ 33.1
PABPC4Q13310 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 33.1
PABPC4Q13310 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -14e-7■■■■■ 33.1
PABPC4Q13310 AMBRA1-206ENST00000528950 4102 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 33.1
PABPC4Q13310 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.422e-7■■■■■ 33.1
PABPC4Q13310 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 33.1
PABPC4Q13310 DMPK-207ENST00000593574 548 ntTSL 425.51■■□□□ 1.672e-6■■■■■ 33.1
PABPC4Q13310 DMPK-218ENST00000600370 723 ntTSL 517.58■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 33.1
PABPC4Q13310 COX5B-202ENST00000464949 613 ntTSL 524.71■■□□□ 1.551e-18■■■■■ 33
PABPC4Q13310 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.481e-12■■■■■ 33
PABPC4Q13310 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.391e-12■■■■■ 33
PABPC4Q13310 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.031e-12■■■■■ 33
PABPC4Q13310 TMED7-TICAM2-203ENST00000514548 736 ntTSL 28.02□□□□□ -1.131e-12■■■■■ 33
PABPC4Q13310 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.731e-8■■■■■ 33
PABPC4Q13310 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.781e-8■■■■■ 33
PABPC4Q13310 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-8■■■■■ 33
PABPC4Q13310 PINK1-AS-201ENST00000451424 4443 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.745e-12■■■■■ 33
PABPC4Q13310 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.565e-8■■■■■ 33
PABPC4Q13310 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.575e-8■■■■■ 33
PABPC4Q13310 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.33e-9■■■■■ 33
PABPC4Q13310 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.566e-8■■■■■ 33
PABPC4Q13310 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.536e-8■■■■■ 33
PABPC4Q13310 FBXO18-202ENST00000379999 3702 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 33
PABPC4Q13310 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.235e-9■■■■■ 32.9
PABPC4Q13310 MEX3D-202ENST00000605173 2132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)22.28■■□□□ 1.165e-9■■■■■ 32.9
PABPC4Q13310 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.233e-13■■■■■ 32.9
PABPC4Q13310 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.173e-13■■■■■ 32.9
PABPC4Q13310 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.153e-13■■■■■ 32.9
PABPC4Q13310 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.973e-13■■■■■ 32.9
PABPC4Q13310 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.53e-13■■■■■ 32.9
PABPC4Q13310 STARD10-202ENST00000400925 541 ntTSL 216.13■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 CNIH1-204ENST00000554683 787 ntTSL 312.65□□□□□ -0.381e-59■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.428e-7■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.428e-7■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 SHMT2-231ENST00000557433 1904 ntTSL 1 (best)17.64■□□□□ 0.428e-7■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 SHMT2-217ENST00000555116 1885 ntTSL 216.86■□□□□ 0.298e-7■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.198e-7■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 SHMT2-226ENST00000556825 2215 ntTSL 1 (best)15.47■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 SHMT2-222ENST00000555774 2311 ntTSL 1 (best)14.79□□□□□ -0.048e-7■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 SHMT2-233ENST00000557529 1369 ntTSL 213.99□□□□□ -0.178e-7■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 SHMT2-207ENST00000553837 2152 ntTSL 513.36□□□□□ -0.278e-7■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.328e-7■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 SHMT2-212ENST00000554467 3416 ntTSL 213□□□□□ -0.338e-7■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 AP2A1-208ENST00000601356 2238 nt25.73■■□□□ 1.711e-8■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 AP2A1-202ENST00000359032 3286 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.695e-10■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.475e-10■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 GYPC-205ENST00000464053 1805 ntTSL 1 (best)17.48■□□□□ 0.395e-10■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.255e-10■■■■■ 32.8
PABPC4Q13310 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.862e-9■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.642e-9■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 SLC39A7-204ENST00000463972 1410 ntTSL 214.99□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.782e-7■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.096e-9■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.066e-9■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.561e-12■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 APRT-207ENST00000567391 667 ntTSL 317.32■□□□□ 0.361e-12■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-12■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 APRT-209ENST00000568319 542 ntTSL 315.54■□□□□ 0.081e-12■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.051e-12■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 APRT-208ENST00000567713 470 ntTSL 513.85□□□□□ -0.191e-12■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.677e-24■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.677e-24■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 HCFC1R1-209ENST00000576921 1199 ntTSL 1 (best)25.46■■□□□ 1.677e-24■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 HCFC1R1-208ENST00000575214 1365 ntTSL 224.74■■□□□ 1.557e-24■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.487e-24■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 HCFC1R1-204ENST00000573095 828 ntTSL 323.6■■□□□ 1.377e-24■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.767e-24■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 HCFC1R1-206ENST00000574151 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.467e-24■■■■■ 32.7
PABPC4Q13310 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.548e-7■■■■■ 32.6
PABPC4Q13310 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.063e-8■■■■■ 32.6
PABPC4Q13310 ARPC1B-220ENST00000491294 1051 ntTSL 521.51■■□□□ 1.032e-17■■■■■ 32.6
PABPC4Q13310 ARPC1B-214ENST00000463078 537 ntTSL 318.41■□□□□ 0.542e-17■■■■■ 32.6
PABPC4Q13310 ARPC1B-217ENST00000481997 945 ntTSL 217.08■□□□□ 0.322e-17■■■■■ 32.6
PABPC4Q13310 MS4A3-202ENST00000358152 1516 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 MS4A3-207ENST00000528952 923 ntTSL 24.82□□□□□ -1.642e-7■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 CHID1-206ENST00000524538 553 ntTSL 225.84■■□□□ 1.732e-7■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.125e-7■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.362e-40■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)17.06■□□□□ 0.322e-40■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 ARHGAP4-205ENST00000404127 3232 ntTSL 518.12■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.581e-18■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 RAB3IL1-203ENST00000526200 636 ntTSL 315.6■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 KLK1-203ENST00000593859 992 ntTSL 220.57■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 32.5
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