Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA3FQ13275 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEMA3FQ13275 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA3FQ13275 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
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