Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGDRQ13258 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGDRQ13258 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTGDRQ13258 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGDRQ13258 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGDRQ13258 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGDRQ13258 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGDRQ13258 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
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