Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF2Q12933 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms