Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCB1Q12824 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCB1Q12824 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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