Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXO1Q12778 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXO1Q12778 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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