Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NUP160Q12769 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
NUP160Q12769 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NUP160Q12769 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
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