Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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