Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC15Q0P6D6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms