Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF543Q08ER8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF543Q08ER8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms