Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE4DQ08499 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE4DQ08499 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE4DQ08499 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms