Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LRP1Q07954 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LRP1Q07954 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms