Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EGR3Q06889 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EGR3Q06889 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EGR3Q06889 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EGR3Q06889 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
EGR3Q06889 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EGR3Q06889 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EGR3Q06889 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EGR3Q06889 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EGR3Q06889 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EGR3Q06889 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EGR3Q06889 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EGR3Q06889 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EGR3Q06889 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 304.3 ms