Protein–RNA interactions for Protein: Q06587

RING1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RING1Q06587 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RING1Q06587 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RING1Q06587 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RING1Q06587 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RING1Q06587 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RING1Q06587 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RING1Q06587 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RING1Q06587 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RING1Q06587 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RING1Q06587 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RING1Q06587 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RING1Q06587 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RING1Q06587 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RING1Q06587 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RING1Q06587 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RING1Q06587 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RING1Q06587 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RING1Q06587 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RING1Q06587 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RING1Q06587 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RING1Q06587 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RING1Q06587 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RING1Q06587 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RING1Q06587 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RING1Q06587 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RING1Q06587 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RING1Q06587 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RING1Q06587 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RING1Q06587 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RING1Q06587 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RING1Q06587 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RING1Q06587 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RING1Q06587 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RING1Q06587 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RING1Q06587 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RING1Q06587 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RING1Q06587 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RING1Q06587 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RING1Q06587 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RING1Q06587 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RING1Q06587 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RING1Q06587 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RING1Q06587 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RING1Q06587 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RING1Q06587 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RING1Q06587 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RING1Q06587 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RING1Q06587 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RING1Q06587 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RING1Q06587 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RING1Q06587 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RING1Q06587 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RING1Q06587 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RING1Q06587 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RING1Q06587 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RING1Q06587 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RING1Q06587 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RING1Q06587 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RING1Q06587 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RING1Q06587 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RING1Q06587 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RING1Q06587 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RING1Q06587 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RING1Q06587 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RING1Q06587 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RING1Q06587 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RING1Q06587 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RING1Q06587 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RING1Q06587 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RING1Q06587 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RING1Q06587 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RING1Q06587 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RING1Q06587 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RING1Q06587 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RING1Q06587 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RING1Q06587 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RING1Q06587 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RING1Q06587 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RING1Q06587 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RING1Q06587 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RING1Q06587 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RING1Q06587 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RING1Q06587 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RING1Q06587 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms