Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDSRQ06136 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDSRQ06136 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms