Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CALD1Q05682 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CALD1Q05682 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CALD1Q05682 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms