Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SSBP1Q04837 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSBP1Q04837 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSBP1Q04837 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms