Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBE1Q04446 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBE1Q04446 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBE1Q04446 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms