Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELAQ04206 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELAQ04206 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELAQ04206 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RELAQ04206 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELAQ04206 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELAQ04206 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELAQ04206 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELAQ04206 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELAQ04206 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELAQ04206 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RELAQ04206 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RELAQ04206 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RELAQ04206 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RELAQ04206 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RELAQ04206 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RELAQ04206 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RELAQ04206 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RELAQ04206 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RELAQ04206 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RELAQ04206 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RELAQ04206 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RELAQ04206 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RELAQ04206 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RELAQ04206 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RELAQ04206 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RELAQ04206 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RELAQ04206 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RELAQ04206 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RELAQ04206 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RELAQ04206 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RELAQ04206 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RELAQ04206 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RELAQ04206 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RELAQ04206 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RELAQ04206 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RELAQ04206 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RELAQ04206 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RELAQ04206 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RELAQ04206 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RELAQ04206 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RELAQ04206 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RELAQ04206 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RELAQ04206 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RELAQ04206 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RELAQ04206 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RELAQ04206 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RELAQ04206 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RELAQ04206 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RELAQ04206 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RELAQ04206 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RELAQ04206 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RELAQ04206 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RELAQ04206 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RELAQ04206 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RELAQ04206 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RELAQ04206 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RELAQ04206 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RELAQ04206 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RELAQ04206 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RELAQ04206 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RELAQ04206 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RELAQ04206 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RELAQ04206 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RELAQ04206 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RELAQ04206 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RELAQ04206 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RELAQ04206 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RELAQ04206 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RELAQ04206 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RELAQ04206 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RELAQ04206 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RELAQ04206 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RELAQ04206 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RELAQ04206 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RELAQ04206 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RELAQ04206 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RELAQ04206 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RELAQ04206 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RELAQ04206 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RELAQ04206 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RELAQ04206 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RELAQ04206 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RELAQ04206 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RELAQ04206 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RELAQ04206 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RELAQ04206 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RELAQ04206 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RELAQ04206 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RELAQ04206 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RELAQ04206 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RELAQ04206 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RELAQ04206 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RELAQ04206 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RELAQ04206 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RELAQ04206 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RELAQ04206 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RELAQ04206 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RELAQ04206 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RELAQ04206 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms