Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB2Q03252 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNB2Q03252 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNB2Q03252 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms