Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 BUD8YLR353W 1812 nt5.66□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 PTC3YBL056W 1407 nt5.65□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 STB5YHR178W 2232 nt5.65□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 DET1YDR051C 1005 nt5.65□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 RRP8YDR083W 1179 nt5.65□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YGL230CYGL230C 444 nt5.65□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 Q0142Q0142 177 nt5.65□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.65□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 PSF2YJL072C 642 nt5.65□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 FBA1YKL060C 1080 nt5.65□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 YLR312CYLR312C 1197 nt5.65□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 ECM33YBR078W 1290 nt5.65□□□□□ -1.5
SRP1Q02821 ZRC1YMR243C 1329 nt5.65□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YMR1YJR110W 2067 nt5.65□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 CDC19YAL038W 1503 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 UBA2YDR390C 1911 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YDL124WYDL124W 939 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YDL218WYDL218W 954 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 RPN11YFR004W 921 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YFR057WYFR057W 456 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 PEF1YGR058W 1008 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 BTN2YGR142W 1233 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 SPS19YNL202W 879 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 SPS18YNL204C 903 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 ELA1YNL230C 1140 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 TGS1YPL157W 948 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YPL257WYPL257W 582 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 MTC5YDR128W 3447 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 SAS10YDL153C 1833 nt5.64□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 UBP7YIL156W 3216 nt5.63□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 SUM1YDR310C 3189 nt5.63□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 SMD2YLR275W 333 nt5.63□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 SHP1YBL058W 1272 nt5.63□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt5.63□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YBL096CYBL096C 309 nt5.63□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 UFE1YOR075W 1041 nt5.63□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 POC4YPL144W 447 nt5.63□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 CBP1YJL209W 1965 nt5.63□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 GUA1YMR217W 1578 nt5.63□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 TRM1YDR120C 1713 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 PDR18YNR070W 4002 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 ACF2YLR144C 2340 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 RAD55YDR076W 1221 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 SUT1YGL162W 900 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YGR149WYGR149W 1299 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 VMA16YHR026W 642 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 DBP8YHR169W 1296 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 MTC2YKL098W 1074 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 KSH1YNL024C-A 219 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 FYV6YNL133C 522 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 TEP1YNL128W 1305 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 THI2YBR240C 1353 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 MET3YJR010W 1536 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 MKK2YPL140C 1521 nt5.62□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YDR015CYDR015C 240 nt5.61□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 CAX4YGR036C 720 nt5.61□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 RPP1YHR062C 882 nt5.61□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 BDP1YNL039W 1785 nt5.61□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 ARE2YNR019W 1929 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 FBP26YJL155C 1359 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 FPK1YNR047W 2682 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 snR7-LsnR7-L 214 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 HEM3YDL205C 984 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YDR278CYDR278C 318 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 SNZ3YFL059W 897 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YGR111WYGR111W 1203 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 SQT1YIR012W 1296 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 ICS3YJL077C 396 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 CDC8YJR057W 651 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YNL120CYNL120C 486 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 AIM39YOL053W 1188 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YNG1YOR064C 660 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 PNT1YOR266W 1272 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 LOA1YPR139C 903 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 RSC30YHR056C 2652 nt5.6□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 EUG1YDR518W 1554 nt5.59□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 MEK1YOR351C 1494 nt5.59□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 MSY1YPL097W 1479 nt5.59□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 EXO1YOR033C 2109 nt5.59□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YDR444WYDR444W 2064 nt5.59□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 TYR1YBR166C 1359 nt5.59□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 HTD2YHR067W 843 nt5.59□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 SDS3YIL084C 984 nt5.59□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 ECM19YLR390W 339 nt5.59□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YLR462WYLR462W 609 nt5.59□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 RRG9YNL213C 645 nt5.59□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YNL285WYNL285W 372 nt5.59□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 HUA2YOR284W 732 nt5.59□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 YPR202WYPR202W 717 nt5.59□□□□□ -1.51
SRP1Q02821 ART10YLR392C 1557 nt5.59□□□□□ -1.52
SRP1Q02821 SKS1YPL026C 1509 nt5.58□□□□□ -1.52
SRP1Q02821 PUT1YLR142W 1431 nt5.58□□□□□ -1.52
SRP1Q02821 ASA1YPR085C 1332 nt5.58□□□□□ -1.52
SRP1Q02821 SDH4YDR178W 546 nt5.58□□□□□ -1.52
SRP1Q02821 YER010CYER010C 705 nt5.58□□□□□ -1.52
SRP1Q02821 YJR146WYJR146W 354 nt5.58□□□□□ -1.52
SRP1Q02821 YLL037WYLL037W 381 nt5.58□□□□□ -1.52
SRP1Q02821 USB1YLR132C 873 nt5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.6 ms