Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP4Q02446 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP4Q02446 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SP4Q02446 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP4Q02446 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP4Q02446 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP4Q02446 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP4Q02446 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP4Q02446 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP4Q02446 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP4Q02446 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP4Q02446 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP4Q02446 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP4Q02446 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP4Q02446 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SP4Q02446 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SP4Q02446 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SP4Q02446 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SP4Q02446 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SP4Q02446 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP4Q02446 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SP4Q02446 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SP4Q02446 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SP4Q02446 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SP4Q02446 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SP4Q02446 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SP4Q02446 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SP4Q02446 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SP4Q02446 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SP4Q02446 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SP4Q02446 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SP4Q02446 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SP4Q02446 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SP4Q02446 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SP4Q02446 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP4Q02446 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP4Q02446 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP4Q02446 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP4Q02446 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SP4Q02446 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP4Q02446 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP4Q02446 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP4Q02446 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP4Q02446 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP4Q02446 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP4Q02446 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP4Q02446 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP4Q02446 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP4Q02446 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP4Q02446 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP4Q02446 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP4Q02446 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP4Q02446 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP4Q02446 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP4Q02446 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SP4Q02446 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP4Q02446 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP4Q02446 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SP4Q02446 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP4Q02446 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP4Q02446 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SP4Q02446 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP4Q02446 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP4Q02446 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP4Q02446 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP4Q02446 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP4Q02446 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP4Q02446 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP4Q02446 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP4Q02446 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SP4Q02446 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SP4Q02446 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms