Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPEQ02224 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms