Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC6A3Q01959 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A3Q01959 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms