Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFAP4Q01664 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TFAP4Q01664 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFAP4Q01664 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms