Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1BQ00975 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CACNA1BQ00975 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms