Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK17Q00537 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK17Q00537 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK17Q00537 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms