Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNTNAP1P78357 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTNAP1P78357 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNTNAP1P78357 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms