Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB4BP68371 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB4BP68371 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms