Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RPS29P62273 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RPS29P62273 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RPS29P62273 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RPS29P62273 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS29P62273 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS29P62273 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS29P62273 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS29P62273 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS29P62273 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS29P62273 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS29P62273 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS29P62273 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS29P62273 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS29P62273 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS29P62273 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS29P62273 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS29P62273 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RPS29P62273 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
RPS29P62273 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS29P62273 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
RPS29P62273 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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