Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RND3P61587 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RND3P61587 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RND3P61587 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RND3P61587 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RND3P61587 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RND3P61587 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RND3P61587 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RND3P61587 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RND3P61587 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RND3P61587 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RND3P61587 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RND3P61587 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND3P61587 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND3P61587 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND3P61587 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND3P61587 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND3P61587 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RND3P61587 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND3P61587 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND3P61587 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND3P61587 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND3P61587 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND3P61587 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND3P61587 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RND3P61587 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND3P61587 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND3P61587 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND3P61587 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RND3P61587 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RND3P61587 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND3P61587 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND3P61587 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND3P61587 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND3P61587 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND3P61587 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RND3P61587 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND3P61587 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND3P61587 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND3P61587 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RND3P61587 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND3P61587 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND3P61587 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND3P61587 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND3P61587 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND3P61587 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND3P61587 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND3P61587 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND3P61587 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND3P61587 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND3P61587 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RND3P61587 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms