Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113P61574 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms