Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP4BP1P59074 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP4BP1P59074 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms