Protein–RNA interactions for Protein: P58546

MTPN, Myotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTPNP58546 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTPNP58546 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTPNP58546 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MTPNP58546 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTPNP58546 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTPNP58546 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTPNP58546 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTPNP58546 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTPNP58546 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTPNP58546 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTPNP58546 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTPNP58546 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTPNP58546 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTPNP58546 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTPNP58546 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTPNP58546 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTPNP58546 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTPNP58546 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTPNP58546 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTPNP58546 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTPNP58546 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTPNP58546 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTPNP58546 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTPNP58546 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTPNP58546 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTPNP58546 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTPNP58546 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTPNP58546 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTPNP58546 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTPNP58546 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTPNP58546 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTPNP58546 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTPNP58546 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTPNP58546 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTPNP58546 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTPNP58546 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTPNP58546 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTPNP58546 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTPNP58546 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTPNP58546 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTPNP58546 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTPNP58546 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTPNP58546 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTPNP58546 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTPNP58546 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTPNP58546 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTPNP58546 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTPNP58546 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTPNP58546 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTPNP58546 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTPNP58546 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTPNP58546 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTPNP58546 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTPNP58546 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTPNP58546 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTPNP58546 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTPNP58546 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTPNP58546 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTPNP58546 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTPNP58546 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTPNP58546 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTPNP58546 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTPNP58546 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTPNP58546 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTPNP58546 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTPNP58546 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTPNP58546 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MTPNP58546 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MTPNP58546 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTPNP58546 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTPNP58546 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTPNP58546 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTPNP58546 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTPNP58546 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTPNP58546 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTPNP58546 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTPNP58546 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTPNP58546 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTPNP58546 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTPNP58546 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTPNP58546 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTPNP58546 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms